Oltre al giardino botanico, il museo dispone di un centro multimediale con un acquario che ospita numerose specie dell’Adriatico. Il museo è orientato alla ricerca marina e vanta una biblioteca specializzata in biologia, geologia e paleontologia. I visitatori possono ammirarvi le ricche collezioni e una mostra permanente che ripropone il passato geologico dell’Adriatico. Sono presentati pure alcuni metodi di ricerca oceanografica, dove in una sorta di acquario multimediale sono esposti minerali, invertebrati marini, squali e razze, nonché una raccolta di rettili e anfibi originari dell’area di Rijeka.

Il Museo Nazionale ospita un'enorme collezione: per rendervi un'idea, si contano quasi 780.000 oggetti e, al suo interno, i visitatori possono ammirare opere d'arte di periodi storici differenti (le più antiche risalgono alla preistoria) e popoli diversi (dall'arte polacca, a quella europea, fino ai lavori orientali, la maggior parte dei quali dal Giappone).

Il Museo dispone di varie collezioni, tra cui quelle degli artisti croati Božidar Rašica, Romol Venucci e Slavko Grčko, nonché di diverse raccolte di disegni, opere di grafica e arte mediatica, sculture, manifesti, quadri e fotografie. Le mostre vengono solitamente allestite in via Krešimirova e presso la galleria Mali salon, lungo il Korzo.

Con squali, pinguini, foce e oltre 2.000 altre specie di animali acquatici, non si può non visitare l’acquario di Boston. All’interno dell’Aquarium si possono organizzare tour per l’osservazione delle balene di alto mare nell’Oceano Atlantico.